C 1995 года на предприятии действует система менеджмента качества, которая соответствует стандартам международной организации по стандартизации (ISO). Внедряя международные стандарты ПАО «НЗХК» добилось признания на внутреннем и международном рынках по различным аспектам своей деятельности.

В июне 2004 года на предприятии сертифицирована интегрированная система менеджмента качества и система экологического менеджмента на соответствие требованиям стандартов ISO 9001 и ISO 14001 соответственно. В 2006 году к ним добавился сертификат соответствия системе менеджмента охраны здоровья и безопасности труда OHSAS 18001.

В 2007 году АО «ТВЭЛ» сертифицировало корпоративную систему менеджмента качества, которая объединила все системы менеджмента входящих в контур управления предприятий.

В настоящий момент предприятие имеет сертификат соответствия корпоративной системы менеджмента на соответствие требованиям следующих международных стандартов ISO 9001:2015, ISO 14001:2015, ISO 45001:2018, ISO 50001:2018.